За остваривање квалитета, Правилником о унутрашњој организацији и систематизацији радних места у Заводу за вредновање квалитета образовања и васпитања систематизовано је 50 радних места. У оквиру Правилника дефинисани су послови, одговорности, овлашћења, компетенције и правни захтеви за свако радно место. У оквиру Завода постоје три веће организационе јединице – сектора:
- Кабинет директора
- Секретаријат
- Центар за стандарде
- Центар за испите
- Центар за вредновање и истраживање
- Служба за издавачко-техничке и заједничке послове
